Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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