Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RNF7Q9UBF6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RNF7Q9UBF6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RNF7Q9UBF6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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RNF7Q9UBF6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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