Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms