Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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