Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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