Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms