Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms