Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms