Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms