Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP3-1Q9BYR8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms