Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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