Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms