Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms