Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms