Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHIPL1Q96JK4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPL1Q96JK4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms