Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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