Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
BRK1Q8WUW1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms