Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTLL11Q8NHH1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL11Q8NHH1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms