Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KBTBD3Q8NAB2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KBTBD3Q8NAB2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms