Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE4Q8N205 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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