Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms