Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNDC1Q76NI1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms