Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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