Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms