Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO42Q6P3S6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms