Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms