Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms