Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms