Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms