Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms