Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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TNXAQ16473 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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