Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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