Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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