Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms