Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD3Q15054 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms