Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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