Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HNF4GQ14541 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms