Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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