Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL1Q13616 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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