Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms