Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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