Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RPA4Q13156 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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