Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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