Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms