Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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