Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms