Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms