Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO4P61968 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO4P61968 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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