Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF3P57682 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms