Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AFMP43652 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AFMP43652 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms